根据使用目的不同，滤光片可分为滤光片、干涉滤光片、全内反射滤光片、滤光片、拉曼滤光片、FISH 荧光滤光片和应原位杂交滤光片。 根据滤光片本身功能不同，其可分为激发滤光片、发射滤光片、二向色镜、陷波滤光片、ND滤光片、截止滤光片、长通滤光片、低通滤光片、带通滤光片、紫外滤光片和 UV 滤光片。 根据主要应用领域，滤光片又可分为生物滤光片、医学滤光片和天文学滤光片。滤光片在实际中一般都是以滤光片组的形式来使用。荧光滤光片组一般由三个透镜组成：激发滤光片、二向色镜和发射滤光片，他们都至于滤光片盒中。
滤光片光谱分为T（透过率）光谱和OD（截止深度）光谱。通常我们看滤光片的参数一般会看透射率光谱，但往往荧光相对于激发光的强度很弱，选择滤光片更需要参考阻挡深度光谱图—OD值。OD值更能直观地反映滤光片对光的阻挡特性。OD值与透过率之间的关系如下所示：
比如T＜0.01%，其透过率为10-4，对应OD值为4，对于T＜1%，对应的OD值为2
